آزمایشگاه کووید در تیر ماه ١۳٩٩ به علت بروز اپیدمی بیماری کرونا و نیاز مبرم شهروندان مشهدی به انجام تست کووید را اندازی گردید. این امر در راستای گسترش آزمایشگاه تشخیص مولکولی در مجموعه ی آزمایشگاه های مرکزی بیمارستان قائم انجام شد. این بخش مسئول دریافت نمونه های کرونا از بیماران بستری در بخش های مختلف بیمارستان، افراد مراجعه کننده به کلینیک ویژه بیمارستان قائم و همچنین  نمونه های ارسالی از مراکز بهداشت میباشد. پس از دریافت نمونه ها با رعایت دستورالعمل های بهداشتی، پذیرش آنها انجام و نمونه ها جهت استخراج ویروس کووید آماده سازی میشوند. پس از انجام استخراج، تست Real Time PCR بر روی RNA های استخراج شده از نمونه صورت پذیرفته و نتایج جهت آنالیز و تایید نهایی به رویت مسئول فنی آزمایشگاه می رسد.